1. 生物大模型综合实践，Integrated Practice of Biological Large Models (课程代码：BI00114)
60学时，2学分，课堂授课6学时，上机实践54学时
课程相关信息 (课件下载)
第一章 生物大模型简介 (课件下载) (参考文献)
第二章 模型管理与可视化工具 (课件下载)
第三章 卷积神经网络 (课件下载) (参考文献)
第四章 Transformer预训练语言模型 (课件一) (课件二) (参考文献)
第五章 蛋白质结构预测与蛋白质语言模型 (课件下载) (参考文献)
第六章 组学大模型 (课件下载) (参考文献)
第七章 药物大模型 (课件下载) (参考文献)
说明：
1. 本课程为华中科技大学生物信息学、生物科学、生物技术、生物医学工程和生物制药等生命科学与技术学院各专业的实践环节的选修课，以6学时理论、54学时60学时上机为载体，构建“数据-算法-工程”三位一体的实践育人体系。课程强调“零编程基础、零神经网络基础的快速入门”，聚焦生物领域深度学习、大模型等前沿AI技术落地，系统训练学生从数据预处理、模型构建到部署优化的全流程工程能力，培养跟踪前沿、解决问题的科研素养，强化团队协作与工程伦理意识，确保学生具备可复现、可扩展的AI工程能力。
2. 本课程用于中国大陆或运用简化汉字教学的国家和地区的人工智能生物学、生物信息学相关上机综合实践的教学或参考。
3. 本课件允许他人自由下载、复印、转发，但仅可用于非商业性质的教学和研讨。若有商业用途，需联系课件制作者。
4. 如对课件有疑问，可联系主讲教师：薛宇。
2. 生物大模型综合实践，Integrated Practice of Biological Large Models (课程代码：317300008015)
60学时，2学分，课堂授课7学时，上机实践53学时
课程相关信息 (课件下载)
第一章 生物大模型介绍 (课件下载) (参考文献)
第二章 深度学习运行全流程 (课件下载)
第三章 lightningModule的使用 (课件下载)
第四章 利用SNP预测表型 (课件下载) (参考文献)
第五章 基于Hydra实现模型的高级管理 (课件下载)
第六章 遮蔽掩码大模型 (课件下载) (参考文献)
第七章 HyenaDNA模型训练 (课件下载) (参考文献)
说明：
1. 本课程为华中农业大学信息学院开设的学科专业类课程，面向“农业人工智能+”拔尖创新人才培养项目入选学生。课程聚焦生物领域深度学习技术落地，系统训练学生从数据预处理、模型构建到部署优化的全流程工程能力，培养跟踪前沿、解决问题的科研素养，强化团队协作与工程伦理意识，确保学生具备可复现、可扩展的AI工程能力。
2. 本课程用于中国大陆或运用简化汉字教学的国家和地区的人工智能生物学、生物信息学相关上机综合实践的教学或参考。
3. 本课件允许他人自由下载、复印、转发，但仅可用于非商业性质的教学和研讨。若有商业用途，需联系课件制作者：孙元辉、张逸东。
4. 如对课件有疑问，可联系主讲教师：薛宇、李国亮、胡学海。
3. 生物信息学，Bioinformatics
(For undergraduates)
56学时，2.5学分，课堂授课40学时，上机16学时
